根據(jù)《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局、海關(guān)總署關(guān)于深化增值稅改革有關(guān)政策的公告》（財(cái)政部、國家稅務(wù)總局、海關(guān)總署公告2019年第39號(hào)）第八條規(guī)定，自2019年4月1日起，試行增值稅期末留抵稅額退稅制度。
增值稅退稅分為4種情況，其中留抵退稅不退附加，但可以從后續(xù)計(jì)稅依據(jù)中抵稅。
增值稅留抵退稅的四種情況如何處理
（1）享受即征即退、先征后退、先征后返等優(yōu)惠政策
根據(jù)《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于增值稅、營業(yè)稅、消費(fèi)稅實(shí)行先征后返等辦法有關(guān)城建稅和教育費(fèi)附加政策的通知》（財(cái)稅〔2005〕72號(hào)）中對(duì)三稅（增值稅、營業(yè)稅、消費(fèi)稅，下同）實(shí)行先征后返、先征后退、即征即退辦法的，除另有規(guī)定外，對(duì)隨三稅附征的城市維護(hù)建設(shè)稅和教育費(fèi)附加，一律不予退（返）還。”
根據(jù)《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于軟件產(chǎn)品增值稅政策的通知》（財(cái)稅〔2011〕100號(hào)）第一條第一項(xiàng)規(guī)定，增值稅一般納稅人銷售其自行開發(fā)生產(chǎn)的軟件產(chǎn)品，按17%稅率（現(xiàn)為13%）征收增值稅后，對(duì)其增值稅實(shí)際稅負(fù)超過3%的部分實(shí)行即征即退政策。
案例：
A軟件企業(yè)為位于市區(qū)的增值稅一般納稅人，銷售自行開發(fā)的軟件產(chǎn)品，按13%繳納增值稅，2019年9月取得銷售額（含稅）50萬元，當(dāng)月購進(jìn)生產(chǎn)材料取得增值稅專用發(fā)票20萬元，票面注明的稅額為2.6萬元。當(dāng)月除雇員工資外無其他開銷。
此時(shí)A企業(yè)應(yīng)納增值稅稅額＝50÷1.13×0.13－2.6＝3.15（萬元）
應(yīng)納城建及教育附加＝3.15×（7%＋3%）＝0.32（萬元）
應(yīng)即征即退的增值稅額＝3.15－50÷1.13×3%＝1.82（萬元）
此時(shí)不退還城建及教育附加。
（2）2019年10月以后的留抵稅額退稅
根據(jù)《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于增值稅期末留抵退稅有關(guān)城市維護(hù)建設(shè)稅、教育費(fèi)附加和地方教育附加政策的通知》（財(cái)稅〔2018〕80號(hào)）規(guī)定，對(duì)實(shí)行增值稅期末留抵退稅的納稅人，允許其從城市維護(hù)建設(shè)稅、教育費(fèi)附加和地方教育附加的計(jì)稅（征）依據(jù)中扣除退還的增值稅稅額。”
案例：
A房地產(chǎn)企業(yè)為位于市區(qū)的增值稅一般納稅人，銷售自行開發(fā)的房地產(chǎn)，2019年3月底無留抵稅額。2019年4月末留抵稅額為20萬元，此后每個(gè)月均取得進(jìn)項(xiàng)且無銷售額，A公司納稅信用等級(jí)為B級(jí)，且未享受即征即退、先征后返優(yōu)惠政策，未因偷稅被處罰，也不涉及出口退稅及虛開發(fā)票。2019年9月底，留抵稅額為55萬元，其中50萬元為增值稅專用發(fā)票上注明的可抵扣進(jìn)項(xiàng)，5萬元為取得旅客運(yùn)輸服務(wù)電子普通發(fā)票上注明的稅額。
此時(shí)A企業(yè)可申請(qǐng)退還的留抵稅額＝增量留抵稅額×進(jìn)項(xiàng)構(gòu)成比例×60%＝55×50÷55×60%＝30（萬元）
此時(shí)不退還城建及教育附加，但在10月及后續(xù)所屬期申報(bào)稅款時(shí)，可以按應(yīng)納增值稅稅額減去30萬元的余額，作為計(jì)算繳納城建及教育附加的依據(jù)。
（3）出口退稅
根據(jù)《財(cái)政部關(guān)于城市維護(hù)建設(shè)稅幾個(gè)具體業(yè)務(wù)問題的補(bǔ)充規(guī)定》（財(cái)稅字〔1985〕第143號(hào)）第三條第一款規(guī)定，對(duì)出口產(chǎn)品退還產(chǎn)品稅，增值稅的，不退還已納的城市維護(hù)建設(shè)稅。
案例：
A自營出口生產(chǎn)企業(yè)為位于市區(qū)的增值稅一般納稅人，出口貨物的征稅稅率為13%，退稅率為10%。2019年9月，購進(jìn)原材料一批，取得增值稅專用發(fā)票，注明的進(jìn)項(xiàng)稅額34萬元，已驗(yàn)收入庫。上期留抵稅額6萬元。本月內(nèi)銷貨物不含稅銷售額100萬元，出口貨物銷售額折合人民幣200萬元。
免抵退稅不得免征和抵扣稅額＝當(dāng)期出口貨物離岸價(jià)×外匯人民幣牌價(jià)×（出口貨物征稅稅率－出口貨物退稅率）＝200×（13%－10%）＝6（萬元）
當(dāng)期應(yīng)納稅額＝當(dāng)期內(nèi)銷貨物的銷項(xiàng)稅額－（當(dāng)期進(jìn)項(xiàng)稅額－當(dāng)期免抵退稅不得免征和抵扣稅額）－留抵稅額＝100×13%－（34－6）－6＝－21（萬元）
出口貨物“免、抵、退”稅額＝出口貨物離岸價(jià)×外匯人民幣牌價(jià)×出口貨物退稅率－免抵退稅額抵減額＝200×10%＝20（萬元）
當(dāng)期應(yīng)納稅額－21萬元，免抵退稅額20萬元，應(yīng)退稅額為20萬元，剩余1萬元（21－20）作為留抵稅額結(jié)轉(zhuǎn)下期抵扣。
此時(shí)附加稅費(fèi)不能退還。
（4）其他原因多繳納稅款退稅
多繳納稅款是否可以退稅目前沒有明確規(guī)定，但并無禁止性規(guī)定，根據(jù)《稅收征收管理法》第五十一條規(guī)定，納稅人超過應(yīng)納稅額繳納的稅款，稅務(wù)機(jī)關(guān)發(fā)現(xiàn)后應(yīng)當(dāng)立即退還；納稅人自結(jié)算繳納稅款之日起三年內(nèi)發(fā)現(xiàn)的，可以向稅務(wù)機(jī)關(guān)要求退還多繳的稅款并加算銀行同期存款利息，稅務(wù)機(jī)關(guān)及時(shí)查實(shí)后應(yīng)當(dāng)立即退還；涉及從國庫中退庫的，依照法律、行政法規(guī)有關(guān)國庫管理的規(guī)定退還。
多繳增值稅導(dǎo)致多繳納的附加稅也屬于稅收征管法所規(guī)定的多繳納稅款，沒有禁止性規(guī)定的情形下，應(yīng)可隨增值稅一同退還。
根據(jù)財(cái)稅字〔1985〕第143號(hào)文件第三條第二款規(guī)定，對(duì)由于減免產(chǎn)品稅，增值稅，營業(yè)稅而發(fā)生的退稅，同時(shí)退還已繳納的城市維護(hù)建設(shè)稅。此處的減免不包括出口退稅、先征后返、先征后退、即征即退，基本只剩下直接減免，但直接減免的情況下，增值稅根據(jù)減免后的金額入庫，而城建及附加根據(jù)實(shí)繳增值稅金額計(jì)算入庫，按理說不存在退稅的情形。因此，筆者理解，此處的減免可能存在兩種情況，一是由于新發(fā)布的優(yōu)惠政策溯及既往，導(dǎo)致過去多繳稅的企業(yè)申請(qǐng)退稅；二是納稅人政策理解不到位導(dǎo)致未享受優(yōu)惠，從而對(duì)多繳納稅款申請(qǐng)退稅。
綜上所述，筆者認(rèn)為從征管法規(guī)定及財(cái)稅字〔1985〕第143號(hào)文件第三條第二款規(guī)定的可以確定除出口退稅、先征后返、先征后退、即征即退、留抵退稅外的增值稅多繳納退稅，可以一并退還三項(xiàng)附加稅費(fèi)。
A投資企業(yè)為位于市區(qū)的增值稅小規(guī)模納稅人，2019年9月，取得一筆符合條件的居民企業(yè)之間的股息紅利100萬元，出納人員填列申報(bào)表時(shí)，誤將該股息紅利認(rèn)定為金融商品轉(zhuǎn)讓收益，按5.66（100÷1.06×6%）申報(bào)繳納了增值稅，隨之入庫的城建稅及教育費(fèi)附加為0.57萬元。2019年10月，A公司發(fā)現(xiàn)該問題，向稅務(wù)機(jī)關(guān)申請(qǐng)退還多繳的稅款，稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)予以退還5.66萬元增值稅及0.57萬元的附加稅費(fèi)。
（來源：《稅務(wù)規(guī)劃》2019年第12期）